Microarray

Expression Microarray

mRNA Expression Microarray

mRNA(messenger RNA)는 DNA가 전사과정을 거쳐 생산되는 RNA의 일종이며 단백질 정보를 담고 있는 coding region을 포함하고 있습니다. mRNA의 발현패턴을 분석하는 작업은 특정 환경에서 주요 기능을 하는 유전자와 그 pathway를 찾는데 매우 중요합니다.

mRNA Expression Microarray는 다양한 Organism에 대한 mRNA 분석을 위하여 실험이 진행되며 얻어진 결과데이터를 바탕으로 이를 통계 분석하여 유의한 유전자들을 선별해낼 수 있습니다.

Expression Microarray Platforms

제조사 연구 종 플랫폼
Agilent - Human
- Mouse
- Rat
- Model Org/Non-Human
SurePrint G3 Gene Expression
SurePrint G3 Exon
Customization
기타
Affymetrix Gene ST (Whole Transcript)
GenomeArray (3'IVT)
기타
Life Technologies Taqman mRNA Expression
Openarray Customization

Analysis

분석항목 내용
Data analysis of DE Basic statistics(Fold change, group mean, sd etc.)
Identifying differentially expressed genes(T-test, LPE test, ANOVA etc.)
Multiple testing correction (FDR, Bonferroni etc.)
Clustering Analysis for DEG ( Hierarchical clustering, K-means etc.)
Functional analysis KEGG pathway, GeneOntologyannotation(DAVID, goProfiles, GOstats etc.)
GeneSet Enrichment Analysis
Customized analysis Integrative analysis (mRNA-miRNA, methylation~mRNA, mRNA-CNV etc.)

microRNA Expression Microarray

microRNA는 21-25개 뉴클레오타이드(Nucleotide)로 이루어진 단일서열의 작은 RNA로 mRNA가 번역과정을 거쳐 단백질이 형성되는 기능을 방해함으로써 유전자 발현을 제어하는 역할을 합니다. 해당 microRNA 연구를 통하여 RNA silencing에 대한 이해를 넓힐 수 있습니다.

microRNA는 생성과정에 따라 여러 가지 형태로 존재하며 연구를 통해 알려진 mature miRNA의 발현패턴을 분석하기 위하여 다양한 Microarray 제품들이 준비되어 있습니다. 또한 마크로젠은 Microarray를 사용한 실험 서비스뿐만 아니라 차별발현이 확인된 microRNA 선별, Target mRNA 예측 등의 분석 서비스를 함께 제공하고 있습니다.

miRNA Expression Microarray Platforms

제조사 연구 종 플랫폼
Agilent - Human
- Mouse
- Rat
- Model Org/Non-Human
SurePrint G3 miRNA Expression
Customization
Affymetrix miRNA 4.0 (203 specimens)
Life Technologies Taqman miRNA Expression

Analysis

분석항목 내용
Data analysis of DE Basic statistics(Fold change, group mean, sd etc.)
Identifying differentially expressed genes(T-test, LPE test, ANOVA etc.)
Multiple testing correction (FDR, Bonferroni etc.)
Clustering Analysis for DEG ( Hierarchical clustering, K-means etc.)
Customized analysis Target gene prediction
Integrative analysis (mRNA-miRNA)
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