Transcriptome Sequencing

RNA를 대상으로 하는 Transcriptome Sequencing은 가장 많이 이용되는 연구 방법 중 하나입니다. Reference Genome에 대한 정보가 없는 생물을 연구하는 경우에는 De novo Assembly를 하여 해당 생물에 대한 Transcriptome에 대한 분석이 가능합니다.

Transcriptome 분석을 통해 샘플 간의 유전자 발현 값의 차이(Expression Profiling)를 확인 할 수 있습니다.

mRNA Sequencing

유전자를 지칭하는 염기서열의 숫자를 누적해 발현량을 표현하기 때문에 더욱 정확하며, 추가적으로 Novel Transcriptome, Fusion Gene, Alternative Splicing Variant에 대한 정보도 확인할 수 있어 다양한 연구에 활용할 수 있습니다.

Library Construction Kit

  • < Illumina >
  • - TruSeq RNA
  • - TruSeq stranded mRNA
  • - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat
  • - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Gold Human/Mouse/Rat
  • - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin Human/Mouse/Rat
  • - TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kits with Ribo-Zero Plant
  • - TruSeq RNA (Microbe)
  • - TruSeq stranded mRNA (Microbe)
  • - ScriptSeq™ v2 RNA-Seq Library Preparation Kit (Epicentre)
  • - TruSeq RNA Access
  • - TruSeq Total RNA with Ribo-Zero
  • - TruSeq mRNA (Insert size)
  • - TruSeq Total RNA with Ribo-Zero (Insert size)
  • < Others >
  • - SMARTer Universal Low RNA library
  • - SMARTer Ultra Low Input RNA library
  • - SMARTer Stranded RNA library

Sequencing Platforms

  • - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
  • - NextSeq 500

Small RNA Sequencing

miRNA와 siRNA 등을 포함하는 small RNA는 포유동물에서 진화적으로 잘 보존되어 있는 RNA 기반의 유전자발현 조절기전 핵심인자이며, 발생과정에서 유전자발현을 조절하는 데 관여한다고 알려져 있습니다. 특히나, 21~23개 염기로 이루어진 비 암호화 small RNA들이 siRNA나 miRNA로 작용하는 기전에 대한 연구가 활발히 진행되고 있습니다.

Library Construction Kit

  • < Illumina >
  • - Small RNA library
  • < Others >
  • - SMARTer smRNA library
  • - NEBNext Small RNA library

Sequencing Platforms

  • - HiSeq 2500 / HiSeq 4000
  • - NextSeq 500
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