Metagenome Sequencing

Metagenome Sequencing은 다양한 환경에 존재하는 미생물군집(Microbial Community)을 확인하는 방법으로 주로 Bacteria, Fungi의 분포 및 종류를 분석할 수 있습니다. 즉 특정 환경에서 채집된 샘플이 어떠한 미생물군집으로 이루어져 있는지 알 수 있으며 이들의 상호작용과 역할들을 확인할 수 있습니다.
또한 Fusion Primer를 제작하여 여러 샘플을 섞어 실험이 진행되며, 이에 따라 Bacteria뿐만 아니라 Archaea에 대한 분석도 한번에 진행 가능합니다. 특히 인간의 장내 미생물의 유전자 수는 인간 유전자의 약 150배에 이르는데 최근 장내 미생물들의 게놈(Genome)인 마이크로바이옴(Microbiome)에 대한 중요성까지 부각되면서 Metagenome은 제2의 게놈(Second Genome)이라 불리고 있습니다.

Sequencing Types & Platforms

  • - 16S rRNA Region : MiSeq system
    • - V3 to V4 regions
    • - Customized regions
  • - Full-length 16s rRNA : PacBio RSII system
  • - Shotgun Metagenome : MiSeq / HiSeq4000
  • - 18S rRNA / ITS region : MiSeq system
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