Epigenome Sequencing

Epigenome Sequencing은 외부환경요인에 의하여 특정 유전자의 기능이 제대로 발현되었는가를 확인하는 방법입니다.

유전자의 전사에(Transcription) 대한 후성유전학적인 조절기전은 DNA의 메틸화(methylation) 및 히스톤 단백질(histone protein)의 아세틸화(acetylation)가 가장 대표적이며 NGS기술을 이용하여 더 효과적으로 분석할 수 있습니다.

Whole Genome Bisulfite Sequencing

WGBS 은 메틸화되지 않은 시토신(Cyotsine)을 우라실(Uracil)로 변환시키는 물질인 아황산수소나트륨(Sodium Bisulfite)의 성질을 이용해 DNA를 처리한 후 염기서열을 분석하여 DNA의 메틸화 정도를 관찰하는 방법입니다.

Sequencing Platforms

  • - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000

MBD (Methyl-CpG Binding Domain) Sequencing

DNA가 메틸화되면 특이적으로 CpG 서열에만 단백질(Methyl-Binding Domain, MBD)이 결합하게 됩니다. 이들 단백질에 붙어 있는 DNA 염기서열만을 선택적으로 분석하여 유전체가 얼마나 Methylation 되어 있는지 분석하는 방법이 MBD Sequencing입니다.

Comparison of Epigenomic Application

Application Bisulfite Conversion Advantages
WGBS Yes High resolution
MBD Sequencing No Methylated CpG enrichment
Methylated region enrichment High resolution

Sequencing Platforms

  • - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / NovaSeq 6000
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