CES

20년 이상 축적된 경험과 노하우로 뛰어난 품질의 CES(Capillary
Electrophoresis Sequencing) 서비스를 제공합니다

CES는 Sanger Sequencing 베이스로 진행되며 생화학적 방법을 이용하는 DNA 염기서열 분석 방법입니다.

CESIntro

CES 서비스는 가장 보편화된 서비스인 Standard Sequencing, Identification, Fragment 분석서비스, 기존 Sequencing 방식에서 새롭게 응용된 Customized Sequencing서비스까지 다양한 제품군을 통해 고객 만족을 극대화합니다. 일반 Sequencing 서비스 뿐만 아니라, 고객 요청에 따른 맞춤형 서비스(gDNA추출, Primer 합성, PCR 증폭 및 정제 등)를 통해 고객 만족을 극대화합니다. 온라인 주문 시스템으로 원하는 서비스를 간편하게 의뢰할 수 있으며 주문샘플에 대한 프로세스 모니터링과 최종결과에 따른 사후관리를 진행합니다.

Standard Sequencing

Standard Sequencing은 고객이 의뢰한 PCR product와 Plasmid DNA 등을 Sequencing하는 서비스입니다.

CES 자동화 시스템과 풍부한 경험을 바탕으로 빠르고 정확한 서비스를 제공합니다. 결과 발송 후에는 전문관리자가 사후관리를 도와드립니다.

Standard Sequencing

Features

  • ABI 3730xl System
  • High quality results 및 Normal read length (1,050bp)
  • LIMS (Laboratory Information Management System)를 기반으로 주문접수부터 결과발송까지 실시간 모니터링 가능
  • 샘플접수 후 24시간 내 결과제공(오후 6시이전 접수에 한함)
  • 기본적인 분석서비스 무료제공(BlastN 또는 BlastX를 통한 단백질과 DNA염기서열 수주에서 상동성 검색)
  • Universal primer 무료제공

Standard Sequencing Single/Plate

Standard Sequencing은 Single tube와 96well plate 두 가지로 실험 진행이 가능합니다.

Sequencing Platform

  • 샘플을 Individual tube에 준비하여 의뢰하는 서비스
  • 무료 재반응 서비스 제공

Additional Service

  • PCR product 정제 (Single/Plate 모두가능)
  • Gel extraction
  • Clones 채취 &Plasmid 추출 (Single/Plate/Agar plate 모두가능)
  • BAC/Fosmid/Cosmid 추출
  • Gel running을 통한 농도확인

Difficult Template Sequencing

Standard Sequencing 결과확인 후 또는 고객의 정보를 바탕으로 특이 구조를 보유한 Template를 Sequencing하는 서비스입니다. 특히 아래와 같은 특이구조를 가진 Template에 적합하며 고품질의
개선된 결과를 안정적으로 얻을 수 있습니다.

  • Hairpin 구조의 siRNA
  • 특이한 2차 구조
  • G-rich
  • Homopolymeric tracts(PolyG)
  • GT-Repetitive regions
Difficult Template Sequencing

Identification

범용적으로 사용되는 미생물/생물체의 종을 판별하는 실험을 prep부터 분석까지 패키지로 제공하는 서비스입니다.

Identification

16S/18S/26S rRNA&ITS Region Full Sequencing

16S rRNA gene 27F, 1492R primer를 이용하여 PCR을 진행한 뒤 Inter-primer인 785F, 907R primer로 Sequencing 하여 균을 동정하는 서비스입니다. 고객이 원하는 경우 Primer를 추가 선택/변경하여 약 1,350bp 이상의 염기서열을 제공합니다.

Bacteria+

Bacteria의 경우 16S rRNA gene을 27F, 1492R primer를 이용하여 PCR을 진행한 뒤 Inter-primer인 785F, 907R primer로 Sequencing하여 균을 동정하는 서비스 입니다.
고객이 원하는 경우 Primer를 추가로 선택/변경하여 약 1,350bp 이상의 염기서열을 제공해 드립니다.

Fungi

18S rRNA region의 염기서열 분석을 통해 1,600bp 이상, ITS region의 염기서열 분석을 통해 500bp 이상, 26S rRNA gene(D1/D2/D3 region)의 염기서열 분석을 통해 1,300bp 이상의 결과를 보장합니다.


Fragment

Fregment 서비스는 Genotyping, DNA profiling과 의학적 Mutation detection, Agricultural research 등 매우 다양한 서비스를 포함 하고 있습니다.
마크로젠은 다양한 경험과 노하우를 바탕으로 Microsatellite 분석(VNTRs)서비스를 제공합니다.

Fragment

Fragment 분석 (Genescan)

Fluorescent label로 표지된 Primer를 이용하여 증폭된 PCR product를 Fragment에 따라 분리 및 분석하는 서비스입니다.
Genotyping, DNA profiling과 의학적 Mutation detection, Agricultural research 등에 이용됩니다. 고객이 원할 경우 PCR optimization부터 분석까지 실험 디자인 서비스를 제공합니다.

Service types

  • Microsatellite instability
  • Amplified fragment length polymorphism (AFLP) 분석
  • Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) 분석
  • Relative fluorescent quantization - Loss of heterozygosity (LOH), Aneuploidy assays, and Large chromosomal deletion detection
  • Sequence-related amplified polymorphism (SRAP)

Features

  • 결과 데이터는 FSA 파일로 제공(PDF, Excel 파일 가능)
  • 샘플 도착 후 영업일 기준 3~7일 내 결과제공
  • PCR Optimization에서부터 Fragment 분석까지 고객 맞춤서비스 가능

Customized Sequencing

Customized Sequencing은 동일 조건 하의 sanger sequencing 실험, prep, PCR, Cloning, Pyrosequencing 등을 제공합니다.

Customized Sequencing

PCR Optimization/Amplification

PCR Optimization은 Target region과 관련하여 Reference와 함께 받은 Cell/gDNA의 Primer 디자인, PCR 증폭, Sequencing, BI 리포트를 포함한 전 프로세스 공정을 수행•분석하는 고객 맞춤형 서비스입니다. PCR 증폭, Touch down PCR 증폭, Nested PCR 증폭, FFPE PCR 증폭실험 등 샘플 특이성으로 인해 재실험률이 높은 경우 고객 맞춤형 PCR 증폭 서비스를 통해 문제점을 해결합니다.

Features

  • 고객 맞춤형 서비스
  • 고품질의 결과제공을 위한 pre-test 진행
  • 전문적인 연구인력을 통한 정확하고 신속한 결과발송 및 관리
  • 동물/식물/곤충 등 샘플에서 gDNA추출가능

Pyrosequencing

Pyrosequencing은 Nucleotide가 DNA와 중합이 일어날 때, 생성되는 Pyrophosphate(PPi)를 이용하여 염기서열을 확인하는 Sequencing 서비스입니다.
DNA 서열과 상관없이 특정 Gene의 Expression 레벨을 조절하는 것에 대한 후성유전체학(Epigenetics)의 연구가 활발해지면서 DNA methylation분석 서비스에 대한 관심이 높아지고 있습니다. 이러한 DNA Methylation 분석은 Pyrosequencing 서비스를 통해 매우 정확하고 신뢰도 있는 결과를 기대할 수 있습니다. Pyrosequencing 은 후성유전체학(Epigenetics), Cancer 연구 등에 활용되며, 마크로젠에서 제공하는 NGS 서비스의 결과와 Validation 이 가능하여, 고객님이 결과 정확도를 높이기 용이합니다.

Features

  • Methylation studies
  • SNP & InDel 분석
  • Cancer 연구에 활용
    • - 5% 이하의 low allele frequency도 발견가능
    • - Somatic mutation 분석에 적합
    • - Di-, tri-, tetra allelic mutation 분석 가능
  • NGS결과에 대한 Validation 가능
    • - Biomarker verification
    • - Validation & verification of GWAS & NGS data

NGS Validation

NGS 서비스 이용 후 해당 데이터의 정확도와 신뢰도를 높이기 위해 Sanger Sequencing 방법을 이용하는 검증 서비스입니다.
제공 받은 Chromosome position 또는 Reference sequence를 통해 특정 부위의 SNP와 변이(Mutation) 결과를 분석합니다.
마크로젠에서 제공하는 NGS 서비스와 연계하여 원스탑 서비스로 이용 가능합니다.

Features

  • 마크로젠의 NGS 서비스를 이용한 고객의 경우 해당샘플을 바로 전달 받아 더욱 빠르고 정확한 실험이 가능
  • Chromosome position과 Reference sequence가 확인되면 전체 Primer 디자인부터 Sequencing 결과확인, Variant 비교분석까지One-stop 서비스진행으로 편리한 이용이 가능
  • 보다 정확한 결과전달을 위하여 필요 시 Normal control의 비교 데이터 확인이 가능
  • 동일 부위에 대하여 두 가지 Primer set를 이용한 데이터 확인도 가능

MLST 분석

MLST(Multilocus Sequence Typing) 분석은 Bacteria, Fungi 등 동일 종 내의 균주를 분류하는 분석 방법으로 특이 균종 5~7개 Housekeeping gene을 Sequencing 하여 각각의Sequence Type(ST) 연관 관계를 분석하고, 동일 균종 내 균주별 대립유전자의 조합을 통해 유전적/분자적 진화 관계를 확인합니다.

MLST 분석

One-click Sanger Sequencing

일반적으로 많이 연구되고 있는 특정유전자 변이를 분석하는 방법으로 One-click만으로 편리하고 빠르게 이용하실 수 있습니다. 또한 gDNA추출부터 PCR 증폭, Sequencing 및 SNP분석까지 최적화된 결과를 받아볼 수 있습니다. 마크로젠의 전문연구진과 오랜 노하우를 바탕으로 제작된 맞춤형 Primer set를 통해 특정 Exon 부위를 Sequencing 하여 Variant 분석결과를 제공해 드립니다. Sequencing 결과는 질환의 유전자 분석을 통해 연구, 의학 분야 등에 널리 이용되며 마크로젠의 다년간의 풍부한 경험과 정확한 리퍼런스를 기반하여 각 gene에 적합한 실험 프로세스를 정립하여 정확하게 사용합니다.


Primer Walking

Single primer extension으로 한 번에 읽을 수 없는 Plasmid나 PCR product의 염기서열을 분석하는 서비스이며 보통 2~10kb 정도의 시퀀스 정보를 얻고자 할 때 이용하는 방법입니다. 고객이 직접 제공하거나 지정한 Primer로 End sequencing을 수행한 후 얻은 결과물로부터 Internal primer를 디자인하여 제작합니다. 이는 새로운 Primer로 같은 Template에 반응하여 얻은 결과로부터 적정한 위치에서 Internal primer를 디자인하여 연장하며, 한 방향 당 약 500~800bp 연장이 가능하고 1회 Walking 수행에 4일가량 소요됩니다. Sequencing 결과는 분자생물학 기초연구, 육종연구, 유전질환 연구 등에 사용되며 Primer Design, Synthesis, Sequencing까지 진행함으로 실험기간이 단축됩니다.


Cloning

유전체에서 특정 유전자 또는 특정 DNA 절편을 분리한 뒤 원하는 Cell을 이용한 대량 복제 방법으로 PCR Product를 마크로젠에서 제공하는 Vector(T-vector or Blunt-vector)에 삽입하거나 고객의 Vector(Sub-cloning)로 제공하는 서비스입니다. PCR product의 경우 다양한 원인에 의해 한 종류 이상의 PCR product가 존재할 수 있습니다. 이럴 때 정상적인 Sequencing 결과를 얻을 수 없지만Cloning을 통해 이를 개선할 수 있으며 DNA 대량 복제나 안정적인 보관이 가능합니다.


Human ID

휴먼아이디(Human ID)는 연구 개발 목적의 개인 유전자 감식 서비스를 제공하고 있습니다.

해당 서비스는 개인의 고유한 DNA 패턴을 비교 분석함으로써 직계존속 관계를 확인할 수 있는 친자 확인 검사, 8촌 이내의 부계혈연 관계를 증명할 수 있는 부계 확인 검사, 여성의 모계혈연 관계를 증명하는 모계 확인 검사, 그리고 전사자 유골 등 신원 확인을 위해 수행되는 유골 DNA 검사와 개인식별 검사를 제공하고 있습니다. Human ID는 머리카락, 구강상피세포, 유골, 타액 등 다양한 검사 가능 검체를통하여 유전자 분석 실험을 진행하고 있으며 검사 결과에 대한 99.99%의 정확도를 통해 신뢰할 수 있는 서비스를 제공하고 있습니다.

Human ID

검사목적

  • 직계존속/부계혈연/모계혈연 관계 증명
  • 개인식별 혹은 동일인 여부 확인
  • Mutagenesis 서비스 가능
  • 전사자 등 유골 DNA로 혈연 및 혈족 관계 증명
  • 사건 현장 증거물과 용의자와의 동일 유전자 확인 필요


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